化學工程學系
中原大學化工系成立於民國四十四年，為中原創校四系之一。
民國六十九年成立化學工程學系碩士班，並於同年成立博士班。
民國九十二年成立碩士在職專班。
民國一零四年開始大學部分設綠能、生化與材料組。
總計至一零五學年度止，大學部畢業系友7309人，碩士班畢業系友927人，博士班畢業系友51人。
辦公室位於：工學館303 聯絡電話：03-2654102
土木工程學系
私立中原大學自民國四十四年創校以來，土木工程學系及水利工程學系即伴隨中原在篳簬襤褸中成長、茁壯，位居全國創立土木領域最早學系之一。民國五十五年，土木系增設夜間部；為響應教育部科系整合理念，民國七十年兩系合併為土木及水利工程學系，共招收日間部三班及夜間部一班。民國七十一年成立土木及水利工程研究所，復於民國七十七年更名為土木工程學系暨研究所，並於八十五年開始招收博士班研究生。配合教育部政策，八十六學年度起系所合一，更名為中原大學土木工程學系、碩士班及博士班。夜間部並轉型為第二部，八十九學年度起第二部併入日間部共招收四班。
辦公室位於土木館二樓 聯絡電話：03-2654200～2
機械工程學系
中原大學機械工程學系設立於1964年8月，歷史悠久，學風鼎盛，本系擁有大學部、碩士班及博士班完整學制，教學強調理論與實作並重，課程內容因應產業與科技發展不斷更新，並提供國際學程與世界接軌；研究致力於前瞻且多元的工程學術領域，期能促進科技與經濟之發展，推廣工程學術資源與研究成果以服務社會、貢獻國家。
辦公室位於：工學館203 聯絡電話：03-2654301
生物醫學工程學系
生物醫學工程是融合生物醫學及工程科學之跨領域整合性科技學系。我們戮力於材料、元件、儀器設備及系統研發，助益臨床醫師正確地發現人體症變或使其簡便安全地治療病灶。此外，生物醫學工程師在生醫奈米材料、基因、細胞與組織工程的研究，更將生物科技與醫療科技鏈結在一起，提升醫療保健的創新發展。
- 成立於民國61年，為全國首創之醫學工程學系。
- 民國72年成立碩士班，86年成立博士班，92年成立碩士在職專班。
- 於民國94年1月通過中華工程教育學會國際工程科技教育認證，為全國第一 所通過認證科系。
- 本系畢業系友迄今超過3500人，擁有全國最眾多的醫學工程系友人數。
辦公室位於：工學館203 聯絡電話：03-2654301
環境工程學系
環境工程學系為隸屬工學院之跨領域科系，是台灣最年輕、最新設立的環工學系。自93學年度招收第一屆大學部學生（原名「生物環境工程學系」），100學年度正式設立研究所碩士班，104學年度成立研究所碩士在職專班。
環工系旨在培養畢業生成為兼具環境與能源專業之跨領域人才，設有環境監測智慧化、土壤與地下水污染整治、環境教育、循環經濟、氣候調適等就業學程。課程規劃與研究發展均致力於結合環境整治、能源管理與資源再生三大領域，以整合技術應用於環境污染問題之整治與預防，並努力朝向新能源之開發與管理、循環經濟等領域發展。
辦公室位於：生科大樓三樓 聯絡電話:03-2654901
